Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF449Q6P9G9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF449Q6P9G9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF449Q6P9G9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF449Q6P9G9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF449Q6P9G9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF449Q6P9G9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF449Q6P9G9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF449Q6P9G9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF449Q6P9G9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF449Q6P9G9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF449Q6P9G9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF449Q6P9G9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF449Q6P9G9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF449Q6P9G9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms