Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM53Q6P2H8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM53Q6P2H8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM53Q6P2H8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM53Q6P2H8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM53Q6P2H8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM53Q6P2H8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM53Q6P2H8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM53Q6P2H8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM53Q6P2H8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM53Q6P2H8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM53Q6P2H8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms