Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF343Q6P1L6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF343Q6P1L6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF343Q6P1L6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF343Q6P1L6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF343Q6P1L6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF343Q6P1L6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF343Q6P1L6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms