Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL6Q6ICC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL6Q6ICC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL6Q6ICC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL6Q6ICC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL6Q6ICC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL6Q6ICC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL6Q6ICC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms