Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD13Q5VXD3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD13Q5VXD3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD13Q5VXD3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD13Q5VXD3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD13Q5VXD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD13Q5VXD3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD13Q5VXD3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms