Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF3Q5VWG9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF3Q5VWG9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF3Q5VWG9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF3Q5VWG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF3Q5VWG9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF3Q5VWG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF3Q5VWG9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF3Q5VWG9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF3Q5VWG9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF3Q5VWG9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TAF3Q5VWG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF3Q5VWG9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF3Q5VWG9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms