Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LIN9Q5TKA1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LIN9Q5TKA1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LIN9Q5TKA1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LIN9Q5TKA1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIN9Q5TKA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIN9Q5TKA1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LIN9Q5TKA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LIN9Q5TKA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms