Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZFYVE27Q5T4F4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZFYVE27Q5T4F4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZFYVE27Q5T4F4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZFYVE27Q5T4F4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZFYVE27Q5T4F4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZFYVE27Q5T4F4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZFYVE27Q5T4F4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZFYVE27Q5T4F4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZFYVE27Q5T4F4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZFYVE27Q5T4F4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZFYVE27Q5T4F4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZFYVE27Q5T4F4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZFYVE27Q5T4F4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZFYVE27Q5T4F4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms