Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZK1Q5T2W1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZK1Q5T2W1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZK1Q5T2W1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZK1Q5T2W1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZK1Q5T2W1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZK1Q5T2W1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZK1Q5T2W1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZK1Q5T2W1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1Q5T2W1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZK1Q5T2W1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZK1Q5T2W1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZK1Q5T2W1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1Q5T2W1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1Q5T2W1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1Q5T2W1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms