Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDZK1Q5T2W1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDZK1Q5T2W1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDZK1Q5T2W1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PDZK1Q5T2W1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDZK1Q5T2W1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDZK1Q5T2W1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PDZK1Q5T2W1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDZK1Q5T2W1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDZK1Q5T2W1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDZK1Q5T2W1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDZK1Q5T2W1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZK1Q5T2W1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZK1Q5T2W1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZK1Q5T2W1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDZK1Q5T2W1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZK1Q5T2W1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDZK1Q5T2W1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDZK1Q5T2W1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDZK1Q5T2W1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDZK1Q5T2W1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDZK1Q5T2W1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZK1Q5T2W1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZK1Q5T2W1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZK1Q5T2W1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZK1Q5T2W1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZK1Q5T2W1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZK1Q5T2W1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZK1Q5T2W1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZK1Q5T2W1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZK1Q5T2W1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZK1Q5T2W1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZK1Q5T2W1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZK1Q5T2W1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZK1Q5T2W1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZK1Q5T2W1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZK1Q5T2W1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZK1Q5T2W1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZK1Q5T2W1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZK1Q5T2W1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZK1Q5T2W1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDZK1Q5T2W1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZK1Q5T2W1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZK1Q5T2W1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZK1Q5T2W1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZK1Q5T2W1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZK1Q5T2W1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZK1Q5T2W1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZK1Q5T2W1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZK1Q5T2W1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZK1Q5T2W1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZK1Q5T2W1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZK1Q5T2W1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZK1Q5T2W1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZK1Q5T2W1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZK1Q5T2W1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDZK1Q5T2W1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDZK1Q5T2W1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDZK1Q5T2W1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZK1Q5T2W1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZK1Q5T2W1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZK1Q5T2W1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZK1Q5T2W1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZK1Q5T2W1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDZK1Q5T2W1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZK1Q5T2W1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZK1Q5T2W1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZK1Q5T2W1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZK1Q5T2W1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZK1Q5T2W1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZK1Q5T2W1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZK1Q5T2W1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZK1Q5T2W1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZK1Q5T2W1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDZK1Q5T2W1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZK1Q5T2W1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZK1Q5T2W1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZK1Q5T2W1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZK1Q5T2W1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZK1Q5T2W1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZK1Q5T2W1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZK1Q5T2W1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZK1Q5T2W1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZK1Q5T2W1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZK1Q5T2W1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZK1Q5T2W1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZK1Q5T2W1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZK1Q5T2W1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZK1Q5T2W1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZK1Q5T2W1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZK1Q5T2W1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZK1Q5T2W1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZK1Q5T2W1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms