Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC45A4Q5BKX6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC45A4Q5BKX6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC45A4Q5BKX6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC45A4Q5BKX6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC45A4Q5BKX6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC45A4Q5BKX6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC45A4Q5BKX6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC45A4Q5BKX6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC45A4Q5BKX6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC45A4Q5BKX6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC45A4Q5BKX6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC45A4Q5BKX6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC45A4Q5BKX6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC45A4Q5BKX6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC45A4Q5BKX6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC45A4Q5BKX6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC45A4Q5BKX6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC45A4Q5BKX6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms