Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ODF2Q5BJF6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ODF2Q5BJF6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ODF2Q5BJF6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ODF2Q5BJF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ODF2Q5BJF6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ODF2Q5BJF6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ODF2Q5BJF6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ODF2Q5BJF6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ODF2Q5BJF6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ODF2Q5BJF6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ODF2Q5BJF6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ODF2Q5BJF6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms