Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL39P5Q59GN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL39P5Q59GN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL39P5Q59GN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL39P5Q59GN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL39P5Q59GN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL39P5Q59GN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL39P5Q59GN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL39P5Q59GN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL39P5Q59GN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL39P5Q59GN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL39P5Q59GN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL39P5Q59GN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms