Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPL39P5Q59GN2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPL39P5Q59GN2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL39P5Q59GN2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL39P5Q59GN2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL39P5Q59GN2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL39P5Q59GN2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPL39P5Q59GN2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPL39P5Q59GN2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPL39P5Q59GN2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPL39P5Q59GN2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPL39P5Q59GN2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPL39P5Q59GN2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL39P5Q59GN2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL39P5Q59GN2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL39P5Q59GN2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL39P5Q59GN2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL39P5Q59GN2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL39P5Q59GN2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL39P5Q59GN2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPL39P5Q59GN2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPL39P5Q59GN2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL39P5Q59GN2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL39P5Q59GN2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL39P5Q59GN2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL39P5Q59GN2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL39P5Q59GN2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL39P5Q59GN2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL39P5Q59GN2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL39P5Q59GN2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL39P5Q59GN2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL39P5Q59GN2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL39P5Q59GN2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL39P5Q59GN2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL39P5Q59GN2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL39P5Q59GN2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL39P5Q59GN2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL39P5Q59GN2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL39P5Q59GN2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL39P5Q59GN2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL39P5Q59GN2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL39P5Q59GN2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL39P5Q59GN2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL39P5Q59GN2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPL39P5Q59GN2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPL39P5Q59GN2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL39P5Q59GN2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL39P5Q59GN2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL39P5Q59GN2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL39P5Q59GN2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL39P5Q59GN2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL39P5Q59GN2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL39P5Q59GN2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL39P5Q59GN2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL39P5Q59GN2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL39P5Q59GN2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL39P5Q59GN2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL39P5Q59GN2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL39P5Q59GN2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL39P5Q59GN2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL39P5Q59GN2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL39P5Q59GN2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL39P5Q59GN2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL39P5Q59GN2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL39P5Q59GN2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL39P5Q59GN2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL39P5Q59GN2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL39P5Q59GN2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL39P5Q59GN2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL39P5Q59GN2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL39P5Q59GN2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL39P5Q59GN2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL39P5Q59GN2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL39P5Q59GN2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL39P5Q59GN2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL39P5Q59GN2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL39P5Q59GN2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL39P5Q59GN2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL39P5Q59GN2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL39P5Q59GN2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL39P5Q59GN2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL39P5Q59GN2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL39P5Q59GN2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL39P5Q59GN2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL39P5Q59GN2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL39P5Q59GN2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL39P5Q59GN2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL39P5Q59GN2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL39P5Q59GN2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL39P5Q59GN2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL39P5Q59GN2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL39P5Q59GN2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL39P5Q59GN2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL39P5Q59GN2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL39P5Q59GN2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL39P5Q59GN2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL39P5Q59GN2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL39P5Q59GN2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL39P5Q59GN2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms