Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP21-2Q3LI59 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms