Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP21-2Q3LI59 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP21-2Q3LI59 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
KRTAP21-2Q3LI59 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
KRTAP21-2Q3LI59 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
KRTAP21-2Q3LI59 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP21-2Q3LI59 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP21-2Q3LI59 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
KRTAP21-2Q3LI59 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
KRTAP21-2Q3LI59 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP21-2Q3LI59 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP21-2Q3LI59 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP21-2Q3LI59 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP21-2Q3LI59 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP21-2Q3LI59 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP21-2Q3LI59 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
KRTAP21-2Q3LI59 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP21-2Q3LI59 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP21-2Q3LI59 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
KRTAP21-2Q3LI59 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP21-2Q3LI59 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP21-2Q3LI59 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP21-2Q3LI59 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP21-2Q3LI59 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP21-2Q3LI59 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP21-2Q3LI59 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP21-2Q3LI59 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP21-2Q3LI59 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP21-2Q3LI59 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KRTAP21-2Q3LI59 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms