Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
P3H1Q32P28 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
P3H1Q32P28 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
P3H1Q32P28 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
P3H1Q32P28 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
P3H1Q32P28 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
P3H1Q32P28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
P3H1Q32P28 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P3H1Q32P28 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H1Q32P28 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P3H1Q32P28 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P3H1Q32P28 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P3H1Q32P28 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H1Q32P28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H1Q32P28 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H1Q32P28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms