Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RFX7Q2KHR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RFX7Q2KHR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RFX7Q2KHR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RFX7Q2KHR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RFX7Q2KHR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RFX7Q2KHR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RFX7Q2KHR2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RFX7Q2KHR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RFX7Q2KHR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RFX7Q2KHR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RFX7Q2KHR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RFX7Q2KHR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RFX7Q2KHR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RFX7Q2KHR2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RFX7Q2KHR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RFX7Q2KHR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RFX7Q2KHR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms