Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SWI5Q1ZZU3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWI5Q1ZZU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWI5Q1ZZU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SWI5Q1ZZU3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SWI5Q1ZZU3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SWI5Q1ZZU3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SWI5Q1ZZU3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SWI5Q1ZZU3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms