Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-9■■■■■ 29.7
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SRSF7Q16629 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.84e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 39.72□□□□□ -0.854e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 59.63□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 29.7
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SRSF7Q16629 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 28.71□□□□□ -1.014e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 29.7
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SRSF7Q16629 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 37.81□□□□□ -1.164e-9■■■■■ 29.7
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SRSF7Q16629 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 29.5
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SRSF7Q16629 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 518.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.244e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-17■■■■■ 29.4
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SRSF7Q16629 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.646e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.696e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.746e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 43.98□□□□□ -1.776e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-9■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 26.17□□□□□ -1.424e-9■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.693e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-208ENST00000483564 2747 ntTSL 37.76□□□□□ -1.177e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-210ENST00000489333 592 ntTSL 27.57□□□□□ -1.27e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 36.15□□□□□ -1.427e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-212ENST00000495862 238 ntTSL 33.75□□□□□ -1.817e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 518.9■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-24■■■■■ 28.4
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