Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.84e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 39.72□□□□□ -0.854e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 59.63□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 29.52□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.95□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 28.71□□□□□ -1.014e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 37.81□□□□□ -1.164e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 47.5□□□□□ -1.214e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 56.87□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 29.7
SRSF7Q16629 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 29.6
SRSF7Q16629 CDR2-207ENST00000569045 826 ntTSL 512.85□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 29.6
SRSF7Q16629 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.535e-9■■■■■ 29.6
SRSF7Q16629 CDR2-204ENST00000564542 1056 ntTSL 510.86□□□□□ -0.675e-9■■■■■ 29.6
SRSF7Q16629 CDR2-203ENST00000563573 556 ntTSL 44.26□□□□□ -1.735e-9■■■■■ 29.6
SRSF7Q16629 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 29.5
SRSF7Q16629 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 29.5
SRSF7Q16629 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 29.5
SRSF7Q16629 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 518.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-205ENST00000444184 1887 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.244e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-210ENST00000608272 612 ntTSL 510□□□□□ -0.814e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 59.97□□□□□ -0.814e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.834e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-213ENST00000622120 355 ntTSL 59.74□□□□□ -0.854e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.034e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 LINC00963-214ENST00000622680 781 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.054e-17■■■■■ 29.4
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SRSF7Q16629 LINC00963-209ENST00000607931 473 ntTSL 56.49□□□□□ -1.374e-17■■■■■ 29.4
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SRSF7Q16629 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 54.65□□□□□ -1.674e-17■■■■■ 29.4
SRSF7Q16629 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 29.3
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SRSF7Q16629 UTRN-208ENST00000433557 354 ntTSL 417.69■□□□□ 0.427e-9■■■■■ 29.1
SRSF7Q16629 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 213.32□□□□□ -0.287e-9■■■■■ 29.1
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SRSF7Q16629 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.497e-9■■■■■ 29.1
SRSF7Q16629 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.647e-17■■■■■ 29.1
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SRSF7Q16629 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 29.1
SRSF7Q16629 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 29.1
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SRSF7Q16629 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.576e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.616e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.646e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.696e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.746e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 43.98□□□□□ -1.776e-17■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-9■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 26.17□□□□□ -1.424e-9■■■■■ 28.7
SRSF7Q16629 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.693e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-208ENST00000483564 2747 ntTSL 37.76□□□□□ -1.177e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-210ENST00000489333 592 ntTSL 27.57□□□□□ -1.27e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-204ENST00000462018 650 ntTSL 36.15□□□□□ -1.427e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 GABRE-212ENST00000495862 238 ntTSL 33.75□□□□□ -1.817e-9■■■■■ 28.6
SRSF7Q16629 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 28.5
SRSF7Q16629 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 518.9■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-24■■■■■ 28.4
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