Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF13Q15543 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF13Q15543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF13Q15543 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF13Q15543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF13Q15543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF13Q15543 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF13Q15543 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF13Q15543 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF13Q15543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF13Q15543 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF13Q15543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF13Q15543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF13Q15543 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF13Q15543 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF13Q15543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF13Q15543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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