Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARS2Q15031 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARS2Q15031 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARS2Q15031 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LARS2Q15031 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LARS2Q15031 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LARS2Q15031 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LARS2Q15031 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARS2Q15031 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LARS2Q15031 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARS2Q15031 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LARS2Q15031 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LARS2Q15031 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LARS2Q15031 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARS2Q15031 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LARS2Q15031 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LARS2Q15031 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARS2Q15031 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.9 ms