Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.442e-23■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.451e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.511e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.82□□□□□ -0.681e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 49.78□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 58.6□□□□□ -1.031e-323■■■■■ 65
NOLC1Q14978 RPS13-207ENST00000531008 594 ntTSL 26.71□□□□□ -1.341e-44■■■■■ 65
NOLC1Q14978 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.041e-44■■■■■ 65
NOLC1Q14978 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.739e-12■■■■■ 64.6
NOLC1Q14978 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.951e-323■■■■■ 64.4
NOLC1Q14978 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.921e-323■■■■■ 64.4
NOLC1Q14978 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.541e-323■■■■■ 64.4
NOLC1Q14978 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-323■■■■■ 64.4
NOLC1Q14978 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.191e-323■■■■■ 64.4
NOLC1Q14978 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-323■■■■■ 64.4
NOLC1Q14978 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.54□□□□□ -1.527e-112■■■■■ 63.7
NOLC1Q14978 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.21□□□□□ -1.587e-112■■■■■ 63.7
NOLC1Q14978 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 27.41□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 62.2
NOLC1Q14978 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.76□□□□□ -1.651e-323■■■■■ 62.2
NOLC1Q14978 KIF9-206ENST00000443784 1521 ntTSL 215.75■□□□□ 0.114e-13■■■■■ 61.9
NOLC1Q14978 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-13■■■■■ 61.9
NOLC1Q14978 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-13■■■■■ 61.9
NOLC1Q14978 KIF9-211ENST00000487440 2635 ntTSL 215.61■□□□□ 0.094e-13■■■■■ 61.9
NOLC1Q14978 KIF9-201ENST00000265529 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.424e-13■■■■■ 61.9
NOLC1Q14978 KIF9-202ENST00000335044 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.624e-13■■■■■ 61.9
NOLC1Q14978 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 517.46■□□□□ 0.396e-29■■■■■ 61.1
NOLC1Q14978 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.666e-27■■■■■ 60.7
NOLC1Q14978 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.856e-27■■■■■ 60.7
NOLC1Q14978 SNHG26-203ENST00000432668 574 ntTSL 37.7□□□□□ -1.186e-27■■■■■ 60.7
NOLC1Q14978 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.186e-27■■■■■ 60.7
NOLC1Q14978 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 60.7
NOLC1Q14978 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 312.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 60.7
NOLC1Q14978 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-52■■■■■ 60.4
NOLC1Q14978 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-52■■■■■ 60.4
NOLC1Q14978 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.252e-52■■■■■ 60.4
NOLC1Q14978 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.922e-57■■■■■ 60.3
NOLC1Q14978 RPL4-204ENST00000563473 475 ntTSL 36.19□□□□□ -1.421e-323■■■■■ 60.1
NOLC1Q14978 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.541e-323■■■■■ 60.1
NOLC1Q14978 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 218.78■□□□□ 0.65e-45■■■■■ 59.7
NOLC1Q14978 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 315.78■□□□□ 0.125e-45■■■■■ 59.7
NOLC1Q14978 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.575e-45■■■■■ 59.7
NOLC1Q14978 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.795e-45■■■■■ 59.7
NOLC1Q14978 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 26.81□□□□□ -1.325e-45■■■■■ 59.7
NOLC1Q14978 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-323■■■■■ 59.4
NOLC1Q14978 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-323■■■■■ 59.4
NOLC1Q14978 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.2□□□□□ -1.261e-323■■■■■ 59.4
NOLC1Q14978 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.871e-323■■■■■ 58.9
NOLC1Q14978 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.018e-9■■■■■ 58.7
NOLC1Q14978 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.54□□□□□ -1.26e-112■■■■■ 58.4
NOLC1Q14978 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.7□□□□□ -1.346e-112■■■■■ 58.4
NOLC1Q14978 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.376e-112■■■■■ 58.4
NOLC1Q14978 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.87□□□□□ -1.796e-112■■■■■ 58.4
NOLC1Q14978 AC124312.3-201ENST00000567527 1236 ntBASIC12.59□□□□□ -0.392e-15■■■■■ 58.3
NOLC1Q14978 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC14.61□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 57.8
NOLC1Q14978 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.072e-10■■■■■ 57.8
NOLC1Q14978 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 57.6
NOLC1Q14978 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 520.7■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 56.2
NOLC1Q14978 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.445e-112■■■■■ 56.1
NOLC1Q14978 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 314.99□□□□□ -0.011e-78■■■■■ 56.1
NOLC1Q14978 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.81e-78■■■■■ 56.1
NOLC1Q14978 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 36.45□□□□□ -1.387e-32■■■■■ 56
NOLC1Q14978 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt19.01■□□□□ 0.631e-74■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.94□□□□□ -1.31e-74■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 ABHD16A-214ENST00000495769 1892 ntTSL 521.86■■□□□ 1.093e-15■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-15■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.353e-15■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 ABHD16A-207ENST00000475742 1319 ntTSL 517.12■□□□□ 0.333e-15■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 ABHD16A-212ENST00000492084 2260 ntTSL 216.54■□□□□ 0.243e-15■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 ABHD16A-204ENST00000468205 913 ntTSL 213.76□□□□□ -0.213e-15■■■■■ 55.9
NOLC1Q14978 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.145e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.685e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.39□□□□□ -0.755e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.65□□□□□ -0.865e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.995e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.88□□□□□ -0.995e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.09□□□□□ -1.435e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.665e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.815e-112■■■■■ 55.5
NOLC1Q14978 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.565e-10■■■■■ 55
NOLC1Q14978 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.665e-10■■■■■ 55
NOLC1Q14978 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.75e-10■■■■■ 55
NOLC1Q14978 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 26.14□□□□□ -1.435e-10■■■■■ 55
NOLC1Q14978 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-13■■■■■ 55
NOLC1Q14978 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 58.2□□□□□ -1.12e-13■■■■■ 55
NOLC1Q14978 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.12□□□□□ -1.752e-13■■■■■ 55
NOLC1Q14978 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.05□□□□□ -1.762e-13■■■■■ 55
NOLC1Q14978 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.132e-13■■■■■ 55
NOLC1Q14978 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 212.94□□□□□ -0.343e-31■■■■■ 55
NOLC1Q14978 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.151e-323■■■■■ 55
NOLC1Q14978 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 223.38■■□□□ 1.331e-323■■■■■ 54.6
NOLC1Q14978 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.221e-323■■■■■ 54.6
NOLC1Q14978 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 26.29□□□□□ -1.41e-323■■■■■ 53.7
NOLC1Q14978 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.56□□□□□ -21e-323■■■■■ 53.7
NOLC1Q14978 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.641e-323■■■■■ 53.6
NOLC1Q14978 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 520.81■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 53
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