Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMC1AQ14683 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC1AQ14683 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC1AQ14683 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC1AQ14683 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC1AQ14683 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC1AQ14683 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC1AQ14683 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC1AQ14683 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC1AQ14683 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC1AQ14683 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC1AQ14683 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC1AQ14683 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC1AQ14683 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMC1AQ14683 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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