Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2H3Q13889 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2H3Q13889 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2H3Q13889 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2H3Q13889 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2H3Q13889 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2H3Q13889 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H3Q13889 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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