Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
GTF2H3Q13889 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GTF2H3Q13889 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GTF2H3Q13889 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GTF2H3Q13889 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GTF2H3Q13889 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GTF2H3Q13889 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GTF2H3Q13889 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GTF2H3Q13889 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF2H3Q13889 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF2H3Q13889 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GTF2H3Q13889 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GTF2H3Q13889 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF2H3Q13889 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF2H3Q13889 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF2H3Q13889 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GTF2H3Q13889 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2H3Q13889 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF2H3Q13889 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTF2H3Q13889 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GTF2H3Q13889 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GTF2H3Q13889 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2H3Q13889 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2H3Q13889 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2H3Q13889 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF2H3Q13889 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF2H3Q13889 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2H3Q13889 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF2H3Q13889 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF2H3Q13889 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2H3Q13889 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF2H3Q13889 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2H3Q13889 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTF2H3Q13889 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTF2H3Q13889 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTF2H3Q13889 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF2H3Q13889 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2H3Q13889 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF2H3Q13889 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2H3Q13889 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2H3Q13889 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF2H3Q13889 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2H3Q13889 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2H3Q13889 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2H3Q13889 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2H3Q13889 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2H3Q13889 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTF2H3Q13889 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTF2H3Q13889 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF2H3Q13889 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2H3Q13889 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTF2H3Q13889 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2H3Q13889 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2H3Q13889 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2H3Q13889 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2H3Q13889 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF2H3Q13889 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTF2H3Q13889 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTF2H3Q13889 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GTF2H3Q13889 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTF2H3Q13889 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTF2H3Q13889 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GTF2H3Q13889 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF2H3Q13889 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GTF2H3Q13889 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2H3Q13889 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2H3Q13889 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2H3Q13889 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2H3Q13889 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2H3Q13889 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2H3Q13889 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2H3Q13889 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2H3Q13889 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2H3Q13889 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2H3Q13889 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2H3Q13889 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF2H3Q13889 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF2H3Q13889 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2H3Q13889 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF2H3Q13889 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2H3Q13889 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2H3Q13889 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF2H3Q13889 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF2H3Q13889 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF2H3Q13889 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF2H3Q13889 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF2H3Q13889 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2H3Q13889 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2H3Q13889 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF2H3Q13889 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GTF2H3Q13889 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF2H3Q13889 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2H3Q13889 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GTF2H3Q13889 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF2H3Q13889 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2H3Q13889 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2H3Q13889 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2H3Q13889 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2H3Q13889 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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