Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
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