Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNTA1Q13424 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNTA1Q13424 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNTA1Q13424 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNTA1Q13424 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNTA1Q13424 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNTA1Q13424 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNTA1Q13424 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNTA1Q13424 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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