Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNTA1Q13424 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SNTA1Q13424 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNTA1Q13424 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SNTA1Q13424 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNTA1Q13424 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNTA1Q13424 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNTA1Q13424 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SNTA1Q13424 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNTA1Q13424 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNTA1Q13424 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNTA1Q13424 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNTA1Q13424 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNTA1Q13424 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNTA1Q13424 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SNTA1Q13424 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNTA1Q13424 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNTA1Q13424 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNTA1Q13424 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNTA1Q13424 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNTA1Q13424 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNTA1Q13424 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNTA1Q13424 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNTA1Q13424 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNTA1Q13424 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNTA1Q13424 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNTA1Q13424 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNTA1Q13424 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNTA1Q13424 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNTA1Q13424 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNTA1Q13424 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNTA1Q13424 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNTA1Q13424 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNTA1Q13424 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNTA1Q13424 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNTA1Q13424 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNTA1Q13424 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNTA1Q13424 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNTA1Q13424 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNTA1Q13424 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNTA1Q13424 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNTA1Q13424 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNTA1Q13424 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNTA1Q13424 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNTA1Q13424 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNTA1Q13424 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNTA1Q13424 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNTA1Q13424 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNTA1Q13424 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNTA1Q13424 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNTA1Q13424 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNTA1Q13424 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNTA1Q13424 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNTA1Q13424 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNTA1Q13424 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNTA1Q13424 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNTA1Q13424 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNTA1Q13424 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTA1Q13424 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNTA1Q13424 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNTA1Q13424 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTA1Q13424 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNTA1Q13424 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNTA1Q13424 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNTA1Q13424 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNTA1Q13424 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNTA1Q13424 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNTA1Q13424 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNTA1Q13424 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNTA1Q13424 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNTA1Q13424 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNTA1Q13424 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNTA1Q13424 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNTA1Q13424 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNTA1Q13424 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNTA1Q13424 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNTA1Q13424 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNTA1Q13424 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNTA1Q13424 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNTA1Q13424 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNTA1Q13424 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNTA1Q13424 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNTA1Q13424 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNTA1Q13424 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNTA1Q13424 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNTA1Q13424 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNTA1Q13424 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNTA1Q13424 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNTA1Q13424 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNTA1Q13424 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNTA1Q13424 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNTA1Q13424 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNTA1Q13424 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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