Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SEMA3FQ13275 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SEMA3FQ13275 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SEMA3FQ13275 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SEMA3FQ13275 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SEMA3FQ13275 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SEMA3FQ13275 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SEMA3FQ13275 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SEMA3FQ13275 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SEMA3FQ13275 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SEMA3FQ13275 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEMA3FQ13275 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
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