Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SEMA3FQ13275 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SEMA3FQ13275 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SEMA3FQ13275 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SEMA3FQ13275 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SEMA3FQ13275 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SEMA3FQ13275 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
SEMA3FQ13275 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SEMA3FQ13275 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SEMA3FQ13275 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SEMA3FQ13275 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SEMA3FQ13275 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SEMA3FQ13275 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SEMA3FQ13275 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SEMA3FQ13275 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SEMA3FQ13275 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SEMA3FQ13275 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SEMA3FQ13275 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SEMA3FQ13275 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SEMA3FQ13275 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SEMA3FQ13275 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SEMA3FQ13275 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SEMA3FQ13275 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SEMA3FQ13275 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SEMA3FQ13275 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SEMA3FQ13275 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SEMA3FQ13275 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SEMA3FQ13275 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SEMA3FQ13275 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SEMA3FQ13275 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SEMA3FQ13275 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SEMA3FQ13275 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SEMA3FQ13275 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SEMA3FQ13275 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SEMA3FQ13275 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SEMA3FQ13275 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SEMA3FQ13275 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SEMA3FQ13275 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SEMA3FQ13275 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SEMA3FQ13275 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SEMA3FQ13275 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SEMA3FQ13275 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SEMA3FQ13275 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SEMA3FQ13275 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SEMA3FQ13275 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SEMA3FQ13275 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SEMA3FQ13275 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SEMA3FQ13275 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SEMA3FQ13275 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SEMA3FQ13275 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SEMA3FQ13275 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SEMA3FQ13275 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SEMA3FQ13275 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SEMA3FQ13275 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SEMA3FQ13275 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEMA3FQ13275 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SEMA3FQ13275 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SEMA3FQ13275 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SEMA3FQ13275 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SEMA3FQ13275 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEMA3FQ13275 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SEMA3FQ13275 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEMA3FQ13275 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEMA3FQ13275 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SEMA3FQ13275 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SEMA3FQ13275 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SEMA3FQ13275 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SEMA3FQ13275 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SEMA3FQ13275 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SEMA3FQ13275 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SEMA3FQ13275 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SEMA3FQ13275 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SEMA3FQ13275 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SEMA3FQ13275 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SEMA3FQ13275 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SEMA3FQ13275 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SEMA3FQ13275 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SEMA3FQ13275 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SEMA3FQ13275 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEMA3FQ13275 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SEMA3FQ13275 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SEMA3FQ13275 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SEMA3FQ13275 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SEMA3FQ13275 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEMA3FQ13275 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEMA3FQ13275 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEMA3FQ13275 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SEMA3FQ13275 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SEMA3FQ13275 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SEMA3FQ13275 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SEMA3FQ13275 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEMA3FQ13275 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms