Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PPARAQ07869 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PPARAQ07869 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PPARAQ07869 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PPARAQ07869 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PPARAQ07869 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPARAQ07869 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPARAQ07869 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPARAQ07869 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPARAQ07869 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARAQ07869 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPARAQ07869 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARAQ07869 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPARAQ07869 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPARAQ07869 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPARAQ07869 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPARAQ07869 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPARAQ07869 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PPARAQ07869 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PPARAQ07869 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PPARAQ07869 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PPARAQ07869 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PPARAQ07869 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PPARAQ07869 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PPARAQ07869 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PPARAQ07869 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PPARAQ07869 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PPARAQ07869 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms