Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
REG3AQ06141 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
REG3AQ06141 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
REG3AQ06141 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
REG3AQ06141 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REG3AQ06141 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REG3AQ06141 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms