Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REG3AQ06141 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REG3AQ06141 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REG3AQ06141 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REG3AQ06141 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REG3AQ06141 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REG3AQ06141 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REG3AQ06141 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REG3AQ06141 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REG3AQ06141 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REG3AQ06141 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REG3AQ06141 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG3AQ06141 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REG3AQ06141 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REG3AQ06141 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REG3AQ06141 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REG3AQ06141 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
REG3AQ06141 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REG3AQ06141 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REG3AQ06141 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REG3AQ06141 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REG3AQ06141 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REG3AQ06141 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REG3AQ06141 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REG3AQ06141 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REG3AQ06141 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REG3AQ06141 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
REG3AQ06141 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
REG3AQ06141 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
REG3AQ06141 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
REG3AQ06141 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
REG3AQ06141 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG3AQ06141 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REG3AQ06141 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
REG3AQ06141 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REG3AQ06141 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REG3AQ06141 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
REG3AQ06141 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
REG3AQ06141 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
REG3AQ06141 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
REG3AQ06141 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
REG3AQ06141 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
REG3AQ06141 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
REG3AQ06141 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REG3AQ06141 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REG3AQ06141 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REG3AQ06141 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REG3AQ06141 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG3AQ06141 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REG3AQ06141 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG3AQ06141 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG3AQ06141 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG3AQ06141 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REG3AQ06141 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REG3AQ06141 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG3AQ06141 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG3AQ06141 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REG3AQ06141 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REG3AQ06141 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REG3AQ06141 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REG3AQ06141 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REG3AQ06141 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REG3AQ06141 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REG3AQ06141 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REG3AQ06141 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REG3AQ06141 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REG3AQ06141 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REG3AQ06141 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG3AQ06141 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG3AQ06141 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
REG3AQ06141 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
REG3AQ06141 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
REG3AQ06141 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
REG3AQ06141 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
REG3AQ06141 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG3AQ06141 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REG3AQ06141 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG3AQ06141 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG3AQ06141 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
REG3AQ06141 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG3AQ06141 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG3AQ06141 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG3AQ06141 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG3AQ06141 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG3AQ06141 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
REG3AQ06141 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG3AQ06141 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
REG3AQ06141 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
REG3AQ06141 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
REG3AQ06141 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
REG3AQ06141 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
REG3AQ06141 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
REG3AQ06141 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
REG3AQ06141 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms