Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUCB1Q02818 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUCB1Q02818 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUCB1Q02818 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NUCB1Q02818 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUCB1Q02818 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUCB1Q02818 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NUCB1Q02818 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUCB1Q02818 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUCB1Q02818 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUCB1Q02818 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUCB1Q02818 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUCB1Q02818 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUCB1Q02818 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUCB1Q02818 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUCB1Q02818 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NUCB1Q02818 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUCB1Q02818 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUCB1Q02818 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUCB1Q02818 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NUCB1Q02818 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUCB1Q02818 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUCB1Q02818 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUCB1Q02818 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUCB1Q02818 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUCB1Q02818 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUCB1Q02818 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUCB1Q02818 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUCB1Q02818 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUCB1Q02818 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms