Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NUCB1Q02818 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NUCB1Q02818 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
NUCB1Q02818 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NUCB1Q02818 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NUCB1Q02818 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NUCB1Q02818 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NUCB1Q02818 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NUCB1Q02818 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NUCB1Q02818 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NUCB1Q02818 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NUCB1Q02818 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NUCB1Q02818 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NUCB1Q02818 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NUCB1Q02818 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NUCB1Q02818 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NUCB1Q02818 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NUCB1Q02818 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUCB1Q02818 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUCB1Q02818 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NUCB1Q02818 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NUCB1Q02818 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUCB1Q02818 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUCB1Q02818 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NUCB1Q02818 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NUCB1Q02818 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NUCB1Q02818 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NUCB1Q02818 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NUCB1Q02818 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NUCB1Q02818 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NUCB1Q02818 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NUCB1Q02818 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NUCB1Q02818 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NUCB1Q02818 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NUCB1Q02818 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NUCB1Q02818 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NUCB1Q02818 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NUCB1Q02818 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NUCB1Q02818 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUCB1Q02818 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUCB1Q02818 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NUCB1Q02818 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NUCB1Q02818 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NUCB1Q02818 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NUCB1Q02818 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NUCB1Q02818 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NUCB1Q02818 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NUCB1Q02818 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NUCB1Q02818 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NUCB1Q02818 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUCB1Q02818 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUCB1Q02818 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUCB1Q02818 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUCB1Q02818 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUCB1Q02818 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUCB1Q02818 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUCB1Q02818 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUCB1Q02818 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUCB1Q02818 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NUCB1Q02818 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NUCB1Q02818 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NUCB1Q02818 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NUCB1Q02818 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NUCB1Q02818 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NUCB1Q02818 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NUCB1Q02818 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NUCB1Q02818 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUCB1Q02818 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUCB1Q02818 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NUCB1Q02818 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NUCB1Q02818 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NUCB1Q02818 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NUCB1Q02818 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NUCB1Q02818 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NUCB1Q02818 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NUCB1Q02818 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NUCB1Q02818 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NUCB1Q02818 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUCB1Q02818 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUCB1Q02818 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NUCB1Q02818 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NUCB1Q02818 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUCB1Q02818 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUCB1Q02818 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUCB1Q02818 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NUCB1Q02818 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NUCB1Q02818 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUCB1Q02818 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NUCB1Q02818 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUCB1Q02818 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUCB1Q02818 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUCB1Q02818 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NUCB1Q02818 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUCB1Q02818 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NUCB1Q02818 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NUCB1Q02818 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUCB1Q02818 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUCB1Q02818 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUCB1Q02818 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUCB1Q02818 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms