Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK16Q00536 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK16Q00536 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK16Q00536 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK16Q00536 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK16Q00536 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK16Q00536 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK16Q00536 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK16Q00536 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK16Q00536 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK16Q00536 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK16Q00536 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK16Q00536 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK16Q00536 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK16Q00536 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK16Q00536 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK16Q00536 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK16Q00536 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK16Q00536 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK16Q00536 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK16Q00536 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK16Q00536 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms