Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNNC1P63316 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNC1P63316 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNC1P63316 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNC1P63316 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TNNC1P63316 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNC1P63316 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNC1P63316 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNC1P63316 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNC1P63316 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNC1P63316 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNNC1P63316 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms