Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXW4P57775 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXW4P57775 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXW4P57775 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXW4P57775 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXW4P57775 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXW4P57775 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FBXW4P57775 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXW4P57775 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXW4P57775 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXW4P57775 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXW4P57775 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXW4P57775 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms