Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FBXW4P57775 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FBXW4P57775 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FBXW4P57775 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FBXW4P57775 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXW4P57775 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FBXW4P57775 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FBXW4P57775 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXW4P57775 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FBXW4P57775 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXW4P57775 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FBXW4P57775 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FBXW4P57775 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FBXW4P57775 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXW4P57775 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXW4P57775 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXW4P57775 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FBXW4P57775 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FBXW4P57775 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXW4P57775 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXW4P57775 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FBXW4P57775 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXW4P57775 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXW4P57775 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXW4P57775 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXW4P57775 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW4P57775 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW4P57775 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXW4P57775 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXW4P57775 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW4P57775 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW4P57775 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXW4P57775 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW4P57775 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW4P57775 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW4P57775 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXW4P57775 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXW4P57775 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW4P57775 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXW4P57775 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FBXW4P57775 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FBXW4P57775 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FBXW4P57775 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FBXW4P57775 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXW4P57775 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FBXW4P57775 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FBXW4P57775 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXW4P57775 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXW4P57775 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXW4P57775 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXW4P57775 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXW4P57775 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXW4P57775 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXW4P57775 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXW4P57775 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXW4P57775 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW4P57775 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXW4P57775 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXW4P57775 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXW4P57775 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXW4P57775 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXW4P57775 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXW4P57775 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXW4P57775 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXW4P57775 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXW4P57775 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXW4P57775 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXW4P57775 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXW4P57775 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXW4P57775 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXW4P57775 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXW4P57775 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXW4P57775 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXW4P57775 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXW4P57775 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXW4P57775 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXW4P57775 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXW4P57775 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXW4P57775 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXW4P57775 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW4P57775 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW4P57775 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXW4P57775 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXW4P57775 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXW4P57775 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXW4P57775 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXW4P57775 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXW4P57775 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW4P57775 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW4P57775 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXW4P57775 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FBXW4P57775 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW4P57775 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW4P57775 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXW4P57775 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXW4P57775 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW4P57775 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXW4P57775 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXW4P57775 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXW4P57775 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms