Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARD18P57730 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARD18P57730 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARD18P57730 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARD18P57730 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARD18P57730 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARD18P57730 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARD18P57730 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARD18P57730 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARD18P57730 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD18P57730 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD18P57730 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD18P57730 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD18P57730 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD18P57730 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD18P57730 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD18P57730 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD18P57730 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD18P57730 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD18P57730 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD18P57730 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD18P57730 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD18P57730 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD18P57730 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD18P57730 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD18P57730 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD18P57730 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD18P57730 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARD18P57730 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARD18P57730 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARD18P57730 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARD18P57730 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARD18P57730 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARD18P57730 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARD18P57730 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARD18P57730 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARD18P57730 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARD18P57730 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARD18P57730 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD18P57730 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD18P57730 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD18P57730 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARD18P57730 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD18P57730 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARD18P57730 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD18P57730 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARD18P57730 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD18P57730 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD18P57730 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARD18P57730 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CARD18P57730 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARD18P57730 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARD18P57730 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARD18P57730 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARD18P57730 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARD18P57730 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARD18P57730 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARD18P57730 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARD18P57730 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARD18P57730 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARD18P57730 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARD18P57730 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARD18P57730 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CARD18P57730 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARD18P57730 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARD18P57730 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARD18P57730 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD18P57730 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD18P57730 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD18P57730 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARD18P57730 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARD18P57730 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARD18P57730 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD18P57730 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARD18P57730 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CARD18P57730 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD18P57730 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD18P57730 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD18P57730 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CARD18P57730 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD18P57730 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CARD18P57730 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD18P57730 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD18P57730 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD18P57730 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CARD18P57730 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD18P57730 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CARD18P57730 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms