Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG3P56975 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG3P56975 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRG3P56975 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NRG3P56975 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRG3P56975 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRG3P56975 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRG3P56975 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRG3P56975 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRG3P56975 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRG3P56975 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRG3P56975 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRG3P56975 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRG3P56975 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRG3P56975 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG3P56975 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG3P56975 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRG3P56975 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG3P56975 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRG3P56975 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRG3P56975 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG3P56975 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG3P56975 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG3P56975 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRG3P56975 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRG3P56975 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRG3P56975 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG3P56975 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG3P56975 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG3P56975 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRG3P56975 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG3P56975 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG3P56975 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG3P56975 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRG3P56975 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG3P56975 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG3P56975 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG3P56975 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRG3P56975 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRG3P56975 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG3P56975 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRG3P56975 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG3P56975 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRG3P56975 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRG3P56975 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRG3P56975 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRG3P56975 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG3P56975 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRG3P56975 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRG3P56975 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRG3P56975 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRG3P56975 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRG3P56975 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRG3P56975 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRG3P56975 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRG3P56975 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRG3P56975 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRG3P56975 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRG3P56975 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRG3P56975 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRG3P56975 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRG3P56975 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRG3P56975 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRG3P56975 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRG3P56975 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRG3P56975 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRG3P56975 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRG3P56975 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRG3P56975 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRG3P56975 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRG3P56975 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRG3P56975 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRG3P56975 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRG3P56975 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRG3P56975 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRG3P56975 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRG3P56975 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRG3P56975 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRG3P56975 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRG3P56975 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRG3P56975 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRG3P56975 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRG3P56975 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRG3P56975 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRG3P56975 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRG3P56975 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRG3P56975 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRG3P56975 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRG3P56975 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRG3P56975 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRG3P56975 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRG3P56975 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRG3P56975 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRG3P56975 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRG3P56975 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRG3P56975 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRG3P56975 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRG3P56975 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRG3P56975 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRG3P56975 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms