Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTTPP55157 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTTPP55157 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTTPP55157 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTTPP55157 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTTPP55157 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTTPP55157 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTTPP55157 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTTPP55157 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MTTPP55157 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTTPP55157 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTTPP55157 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTTPP55157 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTTPP55157 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTTPP55157 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTTPP55157 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTTPP55157 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTTPP55157 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTTPP55157 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTTPP55157 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTTPP55157 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTTPP55157 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTTPP55157 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTTPP55157 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTTPP55157 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTTPP55157 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTTPP55157 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTTPP55157 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTTPP55157 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTTPP55157 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTTPP55157 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
MTTPP55157 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTTPP55157 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTTPP55157 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTTPP55157 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTTPP55157 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTTPP55157 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTTPP55157 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTTPP55157 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTTPP55157 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTTPP55157 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MTTPP55157 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTTPP55157 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTTPP55157 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTTPP55157 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTTPP55157 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTTPP55157 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTTPP55157 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTTPP55157 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTTPP55157 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTTPP55157 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTTPP55157 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTTPP55157 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTTPP55157 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTTPP55157 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTTPP55157 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTTPP55157 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MTTPP55157 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTTPP55157 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTTPP55157 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTTPP55157 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTTPP55157 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTTPP55157 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTTPP55157 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTTPP55157 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTTPP55157 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTTPP55157 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTTPP55157 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTTPP55157 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTTPP55157 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTTPP55157 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTTPP55157 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTTPP55157 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTTPP55157 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTTPP55157 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTTPP55157 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTTPP55157 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTTPP55157 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTTPP55157 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTTPP55157 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTTPP55157 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTTPP55157 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTTPP55157 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTTPP55157 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTTPP55157 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MTTPP55157 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTTPP55157 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTTPP55157 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTTPP55157 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTTPP55157 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTTPP55157 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTTPP55157 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTTPP55157 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTTPP55157 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTTPP55157 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTTPP55157 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTTPP55157 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTTPP55157 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTTPP55157 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTTPP55157 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms