Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE6CP51160 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6CP51160 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6CP51160 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6CP51160 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE6CP51160 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE6CP51160 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE6CP51160 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE6CP51160 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE6CP51160 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE6CP51160 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE6CP51160 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE6CP51160 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms