Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT6CP48668 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT6CP48668 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT6CP48668 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT6CP48668 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT6CP48668 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT6CP48668 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT6CP48668 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT6CP48668 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT6CP48668 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT6CP48668 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT6CP48668 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT6CP48668 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT6CP48668 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT6CP48668 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT6CP48668 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT6CP48668 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT6CP48668 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms