Protein–RNA interactions for Protein: P48549

KCNJ3, G protein-activated inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ3P48549 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ3P48549 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ3P48549 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNJ3P48549 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNJ3P48549 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ3P48549 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ3P48549 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNJ3P48549 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms