Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A9P48067 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A9P48067 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A9P48067 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A9P48067 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A9P48067 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A9P48067 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A9P48067 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A9P48067 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms