Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPTX2P47972 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPTX2P47972 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPTX2P47972 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPTX2P47972 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPTX2P47972 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPTX2P47972 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPTX2P47972 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPTX2P47972 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NPTX2P47972 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPTX2P47972 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPTX2P47972 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NPTX2P47972 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPTX2P47972 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPTX2P47972 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPTX2P47972 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPTX2P47972 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPTX2P47972 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms