Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NPTX2P47972 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NPTX2P47972 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NPTX2P47972 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NPTX2P47972 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPTX2P47972 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NPTX2P47972 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NPTX2P47972 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPTX2P47972 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NPTX2P47972 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NPTX2P47972 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NPTX2P47972 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NPTX2P47972 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NPTX2P47972 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NPTX2P47972 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NPTX2P47972 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NPTX2P47972 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPTX2P47972 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NPTX2P47972 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NPTX2P47972 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPTX2P47972 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NPTX2P47972 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NPTX2P47972 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPTX2P47972 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NPTX2P47972 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPTX2P47972 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPTX2P47972 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPTX2P47972 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NPTX2P47972 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
NPTX2P47972 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NPTX2P47972 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPTX2P47972 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NPTX2P47972 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NPTX2P47972 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NPTX2P47972 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NPTX2P47972 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NPTX2P47972 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NPTX2P47972 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPTX2P47972 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPTX2P47972 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPTX2P47972 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPTX2P47972 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPTX2P47972 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPTX2P47972 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPTX2P47972 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NPTX2P47972 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NPTX2P47972 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NPTX2P47972 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NPTX2P47972 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NPTX2P47972 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NPTX2P47972 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NPTX2P47972 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NPTX2P47972 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NPTX2P47972 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NPTX2P47972 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NPTX2P47972 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPTX2P47972 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPTX2P47972 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NPTX2P47972 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NPTX2P47972 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NPTX2P47972 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPTX2P47972 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NPTX2P47972 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NPTX2P47972 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NPTX2P47972 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NPTX2P47972 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NPTX2P47972 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPTX2P47972 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPTX2P47972 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPTX2P47972 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPTX2P47972 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPTX2P47972 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPTX2P47972 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPTX2P47972 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPTX2P47972 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPTX2P47972 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NPTX2P47972 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPTX2P47972 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPTX2P47972 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPTX2P47972 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPTX2P47972 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPTX2P47972 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPTX2P47972 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPTX2P47972 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPTX2P47972 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NPTX2P47972 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPTX2P47972 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPTX2P47972 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPTX2P47972 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPTX2P47972 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
NPTX2P47972 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NPTX2P47972 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPTX2P47972 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NPTX2P47972 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NPTX2P47972 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NPTX2P47972 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NPTX2P47972 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NPTX2P47972 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NPTX2P47972 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NPTX2P47972 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms