Protein–RNA interactions for Protein: P42285

SKIV2L2, Superkiller viralicidic activity 2-like 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L2P42285 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SKIV2L2P42285 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIV2L2P42285 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIV2L2P42285 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIV2L2P42285 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2L2P42285 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKIV2L2P42285 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKIV2L2P42285 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKIV2L2P42285 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SKIV2L2P42285 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKIV2L2P42285 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKIV2L2P42285 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms